Alle Bilder einer Serie automatisch ausrichten

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Ich habe eine Foto-Serie (für Timelapse) mit über 1000 Bilder aufgenommen, leider musste ich nach ca. 700 Bildern den Akku wechseln und dazu die Kamera vom Stativ nehmen. Das hat dazu geführt das es im fertigen Video einen Ruck gibt.

 

Nun habe ich die zwei Bilder, vor und nach dem Ruck in Photoshop als geladen und automatisch ausgerichtet. Das hat super funktioniert, darum dachte ich, daran eine Stapelverarbeitung zu machen, bei der ich alle Bilder an einem Ausrichten und ein wenig croppen. 

 

Wenn ich nun zwei Bilder öffne und mittels Datei/Skripten/Dateien in Stapel laden die Bilder in Ebenen bringe kommt beim abspielen der Stapelverarbeitung immer wieder dieser Dialog, bei dem ich "Geöffnete Dateien hinzufügen" und "Quellbilder automatisch ausrichten" anwählen muss.

 

Vielleicht hat mir hier jemand einen anderen Ansatz zum ausrichten der ganzen Sequenz oder zum Aufzeichnen der Aktion??

 

Oder gibt es vielleicht eine Möglichkeit die Bilder mit dem manuell erstellten Muster zu synchronisieren (ähnlich wie in Lightroom) damit die Verzerrung und Beschnitt übernommen werden können?